A Chegada da Família Real
Em 1808 chegava ao Rio de Janeiro o Príncipe Regente D.João e a Rainha D.Maria I. A cidade tornava-se a sede do governo português, o que lhe trouxe um surto de progresso. O Arsenal não foi dos Órgãos que mais lucraram com essa mudança, principalmente por estar decadente o poderio da Marinha Portuguesa. Mesmo assim, sua capacidade foi ampliada para poder apoiar a Esquadra, então sediada no Rio de Janeiro.


Um viajante, em 1808, assim descreveu o Arsenal

"...é um pequeno prédio ao pé do Morro de São Bento, com a fente toda muito exposta por estar inteiramente aberto para o mar. Consiste em uma ou duas oficinas miseráveis e um correr de telheiros sob os quais se vêem uns poucos botes emborcados e onde se pode consertar um mastro".